De kerk van de Sint-Libertusparochie, langs de Nekkerspoelstraat, is in slechte staat. Het dossier voor de renovatie van de kerk is al in 1998 ingeleid. De renovatie werd echter nooit aangevat, vooral omdat niet echt duidelijk was of het kerkgebouw in zijn huidige functie zou blijven bestaan.
Sindsdien is de toestand van de Sint-Libertuskerk zodanig verslechterd, dat men nu dringend beslissingen moet nemen. De kost voor globale renovatie van het gebouw bedraagt intussen immers meerdere miljoenen euro. Bovendien doen sinds enige tijd allerlei (ongegronde) geruchten de ronde over de herbestemming van het gebouw. Recent zaten afgevaardigden van alle betrokken partijen, de gemeenten Sint-Katelijne-Waver, Bonheiden, de stad Mechelen, het aartsbisdom en het vicariaat Vlaams-Brabant en Mechelen, de kerkfabriek, het centraal kerkbestuur en de pastorale eindverantwoordelijke, samen om afspraken te maken over de verdere en dringende afhandeling van dit dossier.
Hierover werden enekele afspraken gemaakt. De federatiepastoor Jan Arnalsteen zal – samen met zijn staf en in overleg met de geloofsgemeenschappen – voor het einde van dit jaar een globaal plan opstellen met betrekking tot de bestemming en het gebruik van álle kerken in Mechelen. Hierin zal men, vanuit pastorale inzichten en doeleinden, aangeven welke kerken in de toekomst verder als cultusplaats zullen behouden blijven en welke niet. Ook de toekomstige bestemming van de Sint-Libertuskerk zal in dit plan verduidelijkt worden. Een beslissing over de renovatie van de kerk zal men pas nemen nadat alle partijen midden januari 2011 gezamenlijk kennis hebben genomen van het pastorale plan. Heel snel wordt overgegaan tot uitvoering van dringende veiligheids- en instandhoudingswerken, de kostprijs hiervoor bedraagt circa €150.000, ongeacht de pastorale beslissing over de toekomstige bestemming van de kerk.