De 1/16 finales vinden plaats op 25, 26 en 27 september 2018.
De loting
1. KSK Heist – SV Zulte Waregem
2. K. AS Eupen – AFC Tubize
3. KRC Genk – SK Lommel
4. KFC Duffel – STVV (match wordt gespeeld op Sint-Truiden)
5. Excl. Moeskroen – Dessel Sport
6. Racing Harelbeke – KV Kortrijk
7. Hoogstraten – KV Oostende
8. Olympic Charleroi – Lokeren
9. MU Izegem Ingelmunster – Waasland Beveren (match wordt gespeeld op Waasland Beveren)
10. KV Mechelen – Antwerp
11. Virton – AA Gent
12. Cercle Brugge – Beerschot Wilrijk
13. Sporting Charleroi – Eendracht Aalst
14. Standard – FC Knokke
15. KMSK Deinze – Club Brugge
16. Anderlecht – Union SG